Responsable plateforme d’analyse bio-informatique de séquençage unicellulaire

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Établissement :
Numéro du poste :
J0421-0978
Titre d'emploi du poste :
Responsable plateforme d’analyse bio-informatique de séquençage unicellulaire
Date d'affichage début :
Le 13 octobre 2021
Date de fin d'affichage :
Le 1 décembre 2021
Catégorie d'emploi :
Recherche et enseignement
Niveau de responsabilité :
Employé
Statut de l'employé :
Temps plein temporaire
Niveau de scolarité :
Doctorat
Nombre de postes :
1
Villes et Arrondissements :
Montréal

Description de l’établissement

Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique. Ses 5 000 employés et ses 500 médecins, dentistes et pharmaciens œuvrent dans un milieu à la fois hautement innovant, où des connaissances sont générées et partagées au quotidien, et respectueux des personnes, plaçant le patient et sa famille au cœur de la pratique. Associé à l'Université de Montréal, le CHU Sainte-Justine est de loin le plus grand centre de formation en pédiatrie au Québec et un chef de file au Canada; il accueille chaque année plus de 4 000 étudiants et stagiaires.

Description du poste

Description sommaire
La plateforme en bio-informatique du séquençage en cellules uniques (“single-cell”) est une nouvelle plateforme scientifique de recherche de la Direction de la recherche du CHU Sainte-Justine (CHUSJ), une initiative dédiée à l’hémato-oncologie pédiatrique qui permettra de répondre aux besoins des chercheurs en matière de technologie innovatrice afin de développer une expertise locale forte dans ce secteur en rapide expansion par la mise en place d’une plateforme d’analyse. Cette plateforme est à la recherche d’un biologiste computationnel hautement qualifié en bio-informatique, dont le mandat principal sera d’épauler les chercheurs du Centre de recherche dans leurs analyses. Le candidat devra être apte à mener à terme différents types d’analyses en lien avec les approches les plus courantes en génomique en cellules uniques (expression, ATAC, V(D)J, CITE-seq, mutations, etc.) mais aussi en approches « bulk » incluant mais non limitées à l’exome, le transcriptome et le génome complet. Le candidat recruté devra être capable de s’adapter rapidement aux nouvelles technologies introduites par les équipes de recherches et pouvoir réaliser l’analyse d’expériences pilotes issues de technologies émergentes. Il devra aussi avoir d’excellentes qualités de communications, contribuer à démocratiser les analyses effectuées et à la formation des membres des équipes et participer à la vie scientifique du Centre de recherche.

Le titulaire agira à titre de personne-ressource pour toute question que les chercheurs et le personnel de recherche pourraient avoir concernant un projet de recherche en lien aux différentes fonctions et responsabilités que le titulaire aura au sein de la plateforme.

Description détaillée
Sous la supervision immédiate du responsable des plateformes communes de la Direction de la recherche et en collaboration étroite avec son directeur scientifique le Dr Vincent-Philippe Lavallée, le candidat aura, de façon progressive et selon les projets priorisés, différentes responsabilités:

* Mener à terme des analyses matures à partir de données brutes de séquençage en cellules uniques incluant documenter et communiquer le processus d’analyse, les résultats, les outils et les techniques utilisées;
* Conseiller les équipes de recherche cherchant à générer des données de type cellules unique sur le design expérimental;
* Interagir couramment avec les membres des différentes équipes de recherche afin d’élaborer des stratégies d’analyses appropriées;
* Gérer et coordonner le travail en bio-informatique effectué dans la plateforme;
* Développer et rédiger des procédures de traitement des données à la plateforme;
* Organiser et hiérarchiser les données sur les serveurs de Compute Canada;
* Développer, coordonner et planifier la facturation mensuelle des services offerts à la plateforme, le tout en respect des grilles de tarification en vigueur.
* Communiquer au client, de manière efficace et en temps opportun, les résultats d'analyses ou de contrôle de la qualité;
* Assurer la formation et l'orientation des nouveaux employés.

* Ph.D. en bioinformatique, en informatique ou équivalent. Une expérience de travail dans le domaine ou un stage post-doctoral connexe seront perçus comme un avantage;
* Expérience démontré en génomique conventionnelle et en cellules uniques;
* Grande compréhension de la biologie des cancers et de la biologie moléculaire (un atout);
* Expérience en code sur plus d'un des langages suivants : python, R, C++, Matlab, etc.
* Expérience avec les bases de données relationnelles (ex MySQL);
* Bonne compétence en « Data management »;
* Proactif et capable de travailler de façon indépendante;
* Excellente rapidité d'exécution, sens de l'organisation et gestion du temps;
* Solides compétences interpersonnelles et esprit d'équipe;
* Grande aptitude d'adaptation et aisance à implanter ou utiliser de nouveaux algorithmes;
* Capacité à travailler efficacement, fortes aptitudes en gestion du stress;
* Maîtrise du français et de l'anglais en milieu de travail.

Profil de compétences
* Faire preuve d’initiative, de débrouillardise et d’autonomie;
* Bonnes habiletés interpersonnelles et excellent service à la clientèle;
* Capacité à travailler sous pression et à gérer efficacement les priorités;
* Faire preuve de jugement et de discernement.

Conditions d’emploi
Il s’agit d’un poste à temps complet (35 hrs/sem), non syndiqué, (période de probation d’un an). La rémunération varie entre 46 114$ et 82 585$ selon l’échelle en vigueur au CHU Sainte-Justine en fonction de l’expérience pertinente reconnue. Les autres conditions sont établies en fonction des normes en vigueur dans l’établissement.

Date prévue d’entrée en fonction : Immédiate

Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : « Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants, à l'enseignement au primaire ou au secondaire, au domaine de la santé ».

Si ce poste vous intéresse, veuillez utiliser notre site de recrutement pour postulez en ligne : http://www.chusj.org/fr/Emplois-benevolat/Emplois-disponibles

Exigences requises

• Ph.D. en bioinformatique, en informatique ou équivalent. Une expérience de travail dans le domaine ou un stage post-doctoral connexe seront perçus comme un avantage;
• Expérience démontré en génomique conventionnelle et en cellules uniques;
• Grande compréhension de la biologie des cancers et de la biologie moléculaire (un atout);
• Expérience en code sur plus d'un des langages suivants : python, R, C++, Matlab, etc.
• Expérience avec les bases de données relationnelles (ex MySQL);
• Bonne compétence en « Data management »;
• Proactif et capable de travailler de façon indépendante;
• Excellente rapidité d'exécution, sens de l'organisation et gestion du temps;
• Solides compétences interpersonnelles et esprit d'équipe;
• Grande aptitude d'adaptation et aisance à implanter ou utiliser de nouveaux algorithmes;
• Capacité à travailler efficacement, fortes aptitudes en gestion du stress;
• Maîtrise du français et de l'anglais en milieu de travail.

Profil de compétences
• Faire preuve d’initiative, de débrouillardise et d’autonomie;
• Bonnes habiletés interpersonnelles et excellent service à la clientèle;
• Capacité à travailler sous pression et à gérer efficacement les priorités;
• Faire preuve de jugement et de discernement.

Conditions d’emploi
Il s’agit d’un poste à temps complet (35 hrs/sem), non syndiqué, (période de probation d’un an). La rémunération varie entre 46 114$ et 82 585$ selon l’échelle en vigueur au CHU Sainte-Justine en fonction de l’expérience pertinente reconnue. Les autres conditions sont établies en fonction des normes en vigueur dans l’établissement.

Date prévue d’entrée en fonction : Immédiate

Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : « Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants, à l'enseignement au primaire ou au secondaire, au domaine de la santé ».

Si ce poste vous intéresse, veuillez utiliser notre site de recrutement pour postulez en ligne : http://www.chusj.org/fr/Emplois-benevolat/Emplois-disponibles

Information additionnelle

Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but d’alléger le texte. Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe d'accès à l'égalité en emploi et invite les femmes, les membres des minorités visibles et des minorités ethniques, les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature. Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection. Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité.